Древние зеленые водоросли имеют клеточную стенку, состоящую из целлюлозы, в то время как у цианобактерий клеточная стенка состоит из пептидогликана.Древние зеленые водоросли содержат хлорофилл а и б, тогда как цианобактерии содержат фикоцианин и другие пигменты.У древних зеленых водорослей имеются органеллы, такие как хлоропласты и митохондрии, в то время как у цианобактерий отсутствуют хлоропласты и они производят энергию с помощью фотосинтеза в цитоплазме.Древние зеленые водоросли могут быть многоклеточными организмами, в то время как цианобактерии обычно одноклеточные.