Эвглена зеленая передвигается с помощью своего хвоста, который называется аксонема. Она использует аксонему для движения водной среды, черпая воду вокруг себя и перемещаясь вперед или назад. В процессе передвижения эвглена также может менять свою форму и направление движения, чтобы достичь нужного места или поглотить пищу.