У водорослей процесс дыхания происходит через поверхность их клеток. Водоросли не имеют специализированных органов для дыхания, поэтому газообмен происходит непосредственно через их цитоплазму. Во время фотосинтеза водоросли поглощают углекислый газ и выделяют кислород. В темное время суток происходит обратный процесс - водоросли поглощают кислород и выделяют углекислый газ. Таким образом, дыхание у водорослей тесно связано с процессом фотосинтеза и зависит от освещенности и наличия углекислого газа в окружающей среде.