Костные рыбы имеют внутренний скелет, состоящий из костей и хрящей. Основной частью их скелета является позвоночник, состоящий из отдельных позвонков, соединенных между собой суставами. Кроме того, у костных рыб есть череп, образованный различными костями, защищающими головной мозг и органы чувств. Кости черепа соединены между собой гибкими швами, что позволяет рыбам открывать и закрывать рот для питания. Также у костных рыб есть костные пластины, образующие ребра и плавники, которые помогают рыбам двигаться в воде.