Да, перед "и тот" нужно поставить запятую, чтобы правильно выделить второго ученика и разделить его от первого: Учительница знает, что Петя, и тот сделал уроки.
Да, перед "и тот" нужно поставить запятую, чтобы правильно выделить второго ученика и разделить его от первого: Учительница знает, что Петя, и тот сделал уроки.