"Не сильный, но продолжительный" – пишется раздельно, так как перед описанием прилагательного "продолжительный" стоит отрицание "не", что делает их сочетание синонимичным "слабый, но продолжительный" или "не мощный, но продолжительный".
"Не сильный, но продолжительный" – пишется раздельно, так как перед описанием прилагательного "продолжительный" стоит отрицание "не", что делает их сочетание синонимичным "слабый, но продолжительный" или "не мощный, но продолжительный".