Да, "по Вашему поручению" выделяется запятыми в данном контексте: "рассмотрено муниципальным учреждением «Рога и копыта»".
Да, "по Вашему поручению" выделяется запятыми в данном контексте: "рассмотрено муниципальным учреждением «Рога и копыта»".